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上海AI实验室MedFM挑战赛升级启动 | NeurIPS 2023

医学图像大模型“一刊一赛” 启动以来,上海人工智能实验室(上海AI实验室)收到众多世界级科研机构的关注和问询。

医学图像分析基础模型应用挑战赛(MedFM)预注册通道在短短一个月内就收到数十份来自北京大学、约翰斯霍普金斯大学等海内外高校和机构的参赛注册申请。该挑战赛已成功申请成为机器学习顶会NeurIPS 2023的正式比赛,并更名为“NeurIPS 2023医学图像分析基础模型应用挑战赛”(以下简称NeurIPS 2023·MedFM)。

《〈Medical Image Analysis〉基础模型特刊》于近期开始陆续从医学和机器视觉领域顶会论文中进行遴选并发出邀请。

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NeurIPS 2023·MedFM已于近期正式启动,本次大赛由上海AI实验室与美国罗格斯大学、英属哥伦比亚大学、香港中文大学、上海交通大学、中国科学技术大学、上海交通大学附属瑞金医院、四川大学附属华西医院、上海同济大学附属仁济医院、中山大学附属第六医院和郑州大学第一附属医院联合主办。

NeurIPS 2023·MedFM旨在促进技术创新,探索医学图像分析领域中全新的学习范式,即运用少量数据样本将大规模预训练通用基础模型迁移应用于医学图像分类任务。挑战赛共设三个临床应用任务,收集了不同模态的数据和对应标注,热忱欢迎医学图像分析和机器学习领域的学术界及产业界人士积极参与。

智慧医疗作为人工智能的一个重要应用领域,可为医生提供更快速、准确的医学图像分析以及诊断治疗方案。当前,依赖高质量有医生标注的数据进行强监督学习依然是医学图像人工智能模型的主流研究范式。然而,数据标注代价大、模型开发训练成本高、模型功能泛化性差等难题,制约了人工智技术在该领域快速发展。与此同时,依托大规模AI模型,研发人员可以仅依靠下游医疗场景的少量数据,针对不同任务低成本、高效率地训练出高性能的应用模型,从而轻松应对各行业场景中小数据、零数据等样本缺乏的细分场景难题。因此,预训练基础模型在面向医学图像分析中的应用范式亟待行业共同探索研究。

NeurIPS 2023·MedFM网址:https://www.shlab.org.cn/medfm


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主旨

促进技术创新,探索医学图像分析领域中全新的学习范式,即运用少量数据样本将大规模预训练通用基础模型迁移应用于医学图像分类任务。

日程

2023年5月26日    大赛启动(发布训练数据)

2023年6月26日    开放测试提交

2023年7月26日    开放终测提交

2023年8月30日    截止提交(大赛评审)

2023年9月30日    公布比赛结果

2023年10月12日    MICCAI GMAI 研讨会(结果汇报)

2023年12月15日    NeurIPS 研讨会(获奖方案介绍)

* 详细日程请参考竞赛网站


奖励

大赛前三名将获得主办方提供的奖金,同时获奖者有机会被邀请投稿至《Medical Image Analysis》特刊(取决于其方法的创新性),前十名将参与大赛综述文章的撰写及投稿。此外,获胜队伍中的学生代表将有机会获得攻读主办方所在机构博士学位的资格。

任务

在训练阶段,参赛者需使用少量私有数据进行初始训练(使用数据中的少数样本)和验证(使用数据集的剩余部分)。挑战赛将设立胸部疾病筛查、病理肿瘤组织分类、结肠镜病灶分类等应用任务,参赛者需要在这些任务中取得尽可能高的性能分数。

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任务1:X光胸片中的疾病筛查

胸部X光检查是常规临床中经常采用的成像技术。许多胸部疾病能够通过该检查发现并建议进行进一步检查来确诊。对常见胸部疾病进行快速筛查和报告可以大大提高临床过程的效率。在这项任务中,参赛者需要应用预训练得到的基础模型并遵循少样本学习(few-shot,例如,每个疾病类别有1、5或10个样本病例)的设置,针对19种常见异常提供准确的胸部疾病筛查。比赛将提供2140张正面射线照相图像作为训练集和2708张图像作为验证集。

任务2:病理图像中病灶组织的分类

在一般病理检查中可以检测组织切片中的病灶和早期癌细胞。病理科医生的日常工作中,需要查看数十张组织切片,其工作强度非常高。在临床诊断中,量化病灶细胞和区域是病理医生的主要目标。通过自动的算法可对病理组织进行分类(是否存在病灶细胞)以简化这一过程。在训练和验证阶段,将提供总共396名患者的10009个结肠镜病理检查的组织图像(训练和验证阶段的4654和5355个组织图像,统一大小分别为1024x1024)。

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任务3:结肠镜检查图像中的病变分类

结直肠癌是全世界最常见和最致命的癌症之一。息肉和溃疡等异常是结直肠癌的前兆。结肠镜检查是检测和早期诊断此类异常的金标准,并可以在现场进行必要的活检,这会显著影响结直肠癌的存活率。大赛将提取总共80名患者的3865张图像(训练和验证阶段为1810张和2055张图像,平均尺寸分别为1280x1024)作为训练集。包括四种类型的病变(溃疡、糜烂、息肉和肿瘤)的图像。

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赛务组联系方式

点击以下链接可了解详情、报名参赛

https://www.shlab.org.cn/medfm

openmedlab@pjlab.org.cn(邮件主题需加前缀 “NeurIPS 2023 MedFM”)


comm@pjlab.org.cn

上海市徐汇区云锦路701号西岸国际人工智能中心37-38层

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